Στο Paint Run 3D, θα πρέπει να βάψετε τις πίστες τρεξίματος με συγκεκριμένα χρώματα. Μπροστά σας στην οθόνη θα είναι ορατοί χαρακτήρες διαφορετικών χρωμάτων, οι οποίοι θα στέκονται σε διαφορετικά σημεία. Χρησιμοποιώντας τα πλήκτρα ελέγχου, θα υποδείξετε προς ποια κατεύθυνση θα κινηθούν οι ήρωές σας. Όπου κι αν τρέξουν, ο δρόμος θα πάρει το ίδιο χρώμα με τον ήρωα. Μόλις το κάνετε αυτό, θα λάβετε πόντους στο παιχνίδι Paint Run 3D και θα προχωρήσετε στο επόμενο επίπεδο του παιχνιδιού.