Ένας γενναίος πολεμιστής νίντζα έπεσε σε παγίδα και τώρα η ζωή του βρίσκεται σε κίνδυνο. Εσείς στο παιχνίδι Ninja Jump & Run θα βοηθήσετε τον ήρωα να επιβιώσει και να βγει από αυτό. Ο ήρωάς σας θα χρειαστεί να τρέξει σε πλατφόρμες που εμφανίζονται από το πουθενά και περιστρέφονται στο διάστημα. Όλοι τους θα χωρίζονται από μια ορισμένη απόσταση. Επομένως, τρέχοντας μέχρι την άκρη μιας πλατφόρμας, ο νίντζα θα πρέπει να κάνει ένα άλμα και να πετάξει στον αέρα για να βρεθεί σε μια άλλη πλατφόρμα.